Nasceu na cidade de Goiás, no dia 24 de junho de 1912, filho de David Emetério Nascimento e de Maria Rodrigues Moraes. Era meio irmão, pelo lado paterno, de Rafael Arcanjo do Nascimento, deputado estadual também natural da cidade de Goiás e que se fixou em Rio Verde, tendo morado algum tempo em Jataí. Rafael faleceu no início da década de 50. Genitor dos ex-deputados Iturival e Iron Nascimento, essa talvez fosse a razão do apelido Joãozinho Rafael ou Joãozinho do Rafael, político da vanguarda do PSD/MDB/PMDB. Faleceu em 19.5.1999.
Era casado com Palmerina Guimarães Nascimento, conhecida por Nenê. Desse matrimônio, o primogênito é Wagner Guimarães Nascimento, médico e político com dois mandatos de deputado estadual e de vereador, duas vezes presidente da Câmara.
João Rafael foi um dos fundadores do Instituto de Assistência a Menores. Durante muitos anos, morou no então distrito de Montividiu. Fixando-se na sede do município, continuou com a profissão que exercia naquela localidade: lojista. Foi membro da Loja Maçônica Estrela Rioverdense.
Por Filadelfo Borges de Lima